ยีนส์ กับ ทรานสคริปต์ และ โปรตีน

วันนี้ไปฟังสัมมนาเรื่อง parvoviruses มาวันนี้ โดย Dr. Max Bergoin (Univ. Montpellier, France) และ Dr. Peter Tijssen (Univ. Quebec, Canada)

น่าสนใจว่าพวกนี้เป็นไวรัสขนาดเล็กมาก ขนาด genome 4-6 kb เอง แต่เปลี่ยนโฮสต์ได้เก่งมาก
มีการจัดไว้สอง subfamilies และมี ยีนัส หรือ genera อยู่ 5 + 4 genera
ถ้าดูจากรหัสจีโนทและทรานสคริปต์ ส่วนมากมีแค่ ๒ ยีนส์เอง คือ NS (non-structural) และ VP (viral coat protein) ปลายสองข้าง ของ ssDNA เป็น hair-pin structure

น่าสนใจว่า จากการเปรียบเทียบศึกษาในไวรัสหลายสิบตัว ทำให้ได้ข้อสรุปว่า
๑ แต่ละยีนสามารถใช้หลายโปรโมเตอร์ได้ เพื่อสร้าง ทรานสคริปต์ หลายตัวที่เริ่มจากคนละจุดกัน ดังนั้นบางทรานสคริปต์หัวจะแหว่งไปทาง 5'
บางยีนมี ORF เล็กจิ๋วอยู่ข้างในอีก
๒ มีการใช้ leaky scanning สำหรับ translation initiation points (ATG)
๓ มีการใช้ alternative splicing ด้วย

ทำให้มีการสร้างทรานสคริปต์ หลายตัว และ โปรตีนหลายตัว

เป็นอุทาหรณ์ว่า หนี่ง ORF สามารถมีหลายๆ transcripts & proteins

ขออนุญาตทบทวนโพสต์เก่าเรื่องนิยามใหม่ของยีนส์นิดหนึ่ง
http://bioinfothai.blogspot.com/2006/06/blog-post.html